神經所光學成像公共平臺成立于 2002 年,現有專業技術人員 7 名,由胡謙博士(qianhu@ion.ac.cn,電話 54921811)負責管理。平臺配備了24 套大型光學成像設備:12 臺共聚焦顯微鏡、4 臺雙光子顯微鏡、4 臺高通量切片成像系統、1 臺超高速共聚焦顯微鏡、1臺超高分辨率熒光顯微鏡、1 臺活細胞工作站、1臺高空間分辨率共聚焦顯微鏡。平臺每周開放 80 小時(周一至周五:上午 9:00 - 晚上 10;00, 周末:下午 2:00 - 晚上 10:00),每年進行約 3 萬小時的光學成像實驗,由經驗豐富的專業技術人員提供實驗咨詢、使用培訓、圖像處理和分析等服務,是國內設備較先進、儀器使用率較高的光學成像公共平臺。
平臺由三個小組組成:
第一組位于生命科學實驗樓一樓(A119 & A107,電話 54921734),配備了7 套大型光學成像設備:3 臺 BRUKER 雙光子顯微鏡、1 臺 BRUKER 超高分辨率熒光顯微鏡、1 臺 BRUKER 高速共聚焦顯微鏡、1 臺NIKON A1R 正置共聚焦顯微鏡、1 臺 NIKON Ti 活細胞工作站。其中,雙光子顯微鏡主要用于活體動物(果蠅、斑馬魚、小鼠、大鼠)深部成像和全腦重構(邊切片邊成像或透明化大腦);超高分辨率熒光顯微鏡主要用于 dSTORM 超高分辨率成像和 TIRF 成像;高速共聚焦顯微鏡主要用于高時間分辨率成像、光刺激、透明化標本快速三維重構。
第二組位于生命科學實驗樓四樓(A438 & A434,電話 54921820),配備了8套大型光學成像設備:1 臺 BRUKER 雙光子顯微鏡、5 臺 NIKON (A1、A1+FLIM+FCS、A1R、C2)共聚焦顯微鏡、2 臺 OLYMPUS FV1000 共聚焦顯微鏡。其中,雙光子顯微鏡主要用于腦片、視網膜、斑馬魚、大小鼠大腦的深部成像;NIKON (A1、A1+FLIM+FCS、A1R、C2)共聚焦顯微鏡主要用于多標記固定標本高分辨率成像、大范圍 3D 拼圖、活細胞成像、FRAP、FRET、FLIM、FCS、FCCS 等實驗。
第三組位于生命科學實驗樓三樓(A331,電話 54921935),配備了 9 套大型光學成像設備:4 臺 OLYMPUS FV3000 共聚焦顯微鏡、1臺OLYMPUS SpinSR 高空間分辨率共聚焦顯微鏡(轉盤式)、3 臺 OLYMPUS VS120 高通量熒光成像系統、1 臺 OLYMPUS VS200全腦尺度高通量熒光自動掃描系統。其中,FV3000 共聚焦顯微鏡主要用于多標記固定標本高分辨率成像(多視野或大范圍 3D 拼圖)、斑馬魚全腦重構、活細胞成像等實驗;VS120/VS200 高通量熒光成像系統主要用于固定標本的明場成像或寬場熒光成像和大范圍 2D 拼圖;SpinSR 轉盤式共聚焦顯微鏡主要用于長時程活細胞成像實驗、FRAP實驗等。
平臺的圖像處理和分析室提供大量商業化軟件(AutoQuant、Image Pro Plus 3D、Imaris、Neurolucida、Neurolucida 360、Stereo Investigator、SVI Huygens Essential、Volocity、Voloom 等)和免費共享軟件(ImageJ、Fiji、IMOD、NeuroStudio、TeraStitcher、Vaa3d 等)供用戶使用,并可根據用戶的需求建立圖像處理和分析方法。2019年為滿足所內用戶日益增多的大數據分析的需要,平臺編寫了可用于大數據剪裁、瀏覽、神經元追蹤(利用著名的 Simple Neurite Tracer 和 NeuroStudio 軟件)的 ImageJ 插件 Neurite Tracer nn。
神經所光學成像公共平臺實行有償服務,所內外用戶均可通過中科院儀器設備共享管理平臺(http://sample.cas.cn/)預約實驗(所外用戶需先電話54921811 咨詢實驗)。歡迎廣大研究人員前來使用,想了解更多請下載《神經所光學成像平臺手冊》。